Todas las actividades académicas del Ateneo están orientadas a la realización de su misión: formar apóstoles, líderes cristianos, clérigos y laicos al servicio de la Iglesia para testimoniar el misterio de Cristo, crear corrientes culturales de pensamiento cristiano que, en plena comunión con el Magisterio de la Iglesia y respondiendo a los interrogantes teóricos y existenciales del hombre, impregnen de espirito cristiano a la sociedad. Para realizar esta misión, el Ateneo propone a sus estudiantes una oferta formativa muy variada. El Ateneo, gracias a sus programas de estudio, trata de poner en práctica y de alinear los siguientes principios: una formación sistemática, estructurada y profundamente arraigada; una formación integral del estudiante para la realización de su misión; una atención explícita al Magisterio de la Iglesia; un diálogo permanente con la cultura y con la sociedad contemporánea, partiendo siempre de una identidad cristiana; un desarrollo de las competencias de liderazgo cristiano para contribuir, de forma más incisiva, a la evangelización y a una relevante interdisciplinariedad.
